Выбор рабочих или календарных дней доступен в 1С:Бухгалтерии 8 начиная с версии 3.0.209. При расчёте в рабочих днях программа использует производственный календарь России. Настройка предусмотрена для расчётов и с покупателями, и с поставщиками.
Перед изменением откройте договор и уточните, какой срок стороны согласовали. Не подменяйте рабочими днями календарные только потому, что так удобнее. Числа на скриншотах ниже — примеры, а не рекомендуемые условия оплаты.
1. Настройте сроки для покупателей
В полном интерфейсе откройте Администрирование → Настройки программы → Параметры учёта → Сроки оплаты покупателями. В простом интерфейсе путь начинается с Настройки → Система → Параметры учёта.
В форме два отдельных срока: погашения долга покупателями и оплаты выставленных счетов. Для нужного поля задайте число дней и выберите рядом рабочие либо календарные дни.

2. Проверьте настройку поставщиков
В тех же параметрах учёта откройте Срок оплаты поставщикам. Укажите срок оплаты вашего долга и вариант подсчёта дней. Не переносите сюда автоматически условия, которые используете для покупателей.

3. Задайте условия отдельного договора
Откройте Справочники → Договоры; в простом интерфейсе — Контрагенты → Договоры. Найдите нужный договор, раскройте блок Расчёты и заполните Срок оплаты: количество и вид дней. Сохраните карточку.

Общие значения служат настройками по умолчанию. Если в договоре или отдельном документе установлен другой срок, при проверке задолженности нужно учитывать и его.
4. Проверьте результат на одном договоре
Сопоставьте условия подписанного договора с сохранёнными значениями в базе. Затем проверьте данные отчёта «Задолженность покупателей по срокам долга» или инвентаризации расчётов с детализацией по срокам: настройки оплаты используются при их заполнении.
Если результат не совпал с ожиданием, запишите исходную дату, число дней и выбранный календарь. Проверьте, нет ли отдельного условия в документе. Для разбора расхождения специалисту по сопровождению 1С понадобятся эти данные и версия программы. Менять настройки сразу по всем договорам до такой проверки не стоит.